医学部现有基础医学与生物科学学院、放射医学与防护学院、公共卫生学院、药学院、护理学院等5个学院、3个临床医学院、9个研究院所和巴斯德学院。现有在校研究生4000余名、全日制本科生5000余名、外国留学生近400名。
医学部现有教职工850余人，三家直属附属医院具有教学职称的教师1080人。 两院 院士3人，欧洲科学院院士1人；中组部 千人计划 4人、 青年千人计划 17人；教育部 长江学者奖励计划 特聘教授和青年学者7人、 跨世纪和新世纪优秀人才计划 5人；人力资源与社会保障部 百千万人才工程 培养对象（国家级）4人；国务院学位评定委员会学科评议组成员4人；国家自然科学 杰出青年基金 获得者13人、 优秀青年基金 获得者9人； 973 首席科学家6人、重大科技专项首席科学家1人、国家重点研发计划项目负责人7人。
医学部现拥有博士后流动站7个，一级学科博士点7个，一级学科专业学位博士点1个；一级学科硕士点9个，专业学位硕士点6个。有国家级重点学科3个，国家重点临床专科8个，国防科工委重点学科2个，省一级学科和二级学科重点学科各4个，省优势学科一期2个、二期3个、三期4个。现有学术型博士生导师203人（含临床52人），临床专业学位型博士生导师94人，硕士生导师510人（含临床205人），临床专业学位型硕士生导师197人。
现有省部共建放射医学与辐射防护国家重点实验室1个、国家国际科技合作基地（国家级国际联合研究中心类）1个、国家临床医学研究中心（血液系统疾病领域）1个、教育部创新团队2个、教育部工程技术研究中心1个，省部级重点实验室7个，省级科技公共服务平台1个，省高校优秀科技创新团队1个、协同创新中心2个，省 双创计划 团队12个。截止目前，共有8个属于医学部或医学相关学科进入全球基本科学指标（ESI）前1%：临床医学、药学与毒理学、生物与生物化学、神经科学与行为科学、分子生物与遗传学、免疫学、农学、环境与生态科学。
现有本科专业15个，其中有国家一流本科专业建设点5个，国家级特色专业建设点1个，江苏省一流本科专业建设点1个；省 十二五 重点专业1个，省品牌专业1个，省特色专业3个；省级实验教学与实践教育中心5个，国家来华留学生英语授课品牌课程2门，国家级双语教学示范课程2门，国家级精品在线开放课程3门，省精品课程1门，省英文授课精品课程7门，普通高等教育本科国家级规划教材2部，省重点/精品教材7部；国家级虚拟仿真实验教学项目2项，获国家级教学成果二等奖1项。附属医院21所（其中直属附属医院4所），教学实习点100多个；生物类校外实习基地18个。
医学部积极开展国际学术交流与合作，先后与美国、英国、法国、德国、日本、韩国、澳大利亚、新加坡等国家及香港、＊＊＊等地区的高校、科研机构建立了广泛的交流与长期的合作关系。
